本发明公开了一种神秘果有效成分的提取方法，将神秘果采摘后剥皮，对其中的神秘果果皮，经液氮冷冻后研磨成神秘果果皮粉末，通过离心分离或得神秘果果皮色素；获取神秘果去皮后的果实部分在神秘果采摘期一个月内，每周向每个生长中的神秘果注射一次维生素A和维生素E，注射点为神秘果根部，注射量为15‑20mL；在神秘果采摘后，沿着圆周方向均匀选取四个注射点，分别注射维生素A和维生素E 6‑10mL，在1％聚维酮碘溶液中浸泡2‑4小时；将神秘果在食盐水中浸泡2‑3天取出，经过浓缩提纯获取维生素C；获取神秘果去皮后的果实部分，将神秘果碾碎成汁液状，提纯获取柠檬酸。