本发明提供了一种制药废水的处理设备及使用所述设备处理废水的方法，包括预处理步骤、生化处理、污泥处理和排放清水步骤。本发明的设备及方法能够有效处理制药厂不同类型的废水，提高废水处理效果，叠螺脱水机结构简单，方便操作，混凝气浮池浮选效果好，性能稳定，占地面积少，操作便捷，污水处理设备处理后出水水质达到《广东省水污染物排放限值》(DB44/26‑2001)第二时段一级标准和《化学合成类制药工业水污染物排放标准》(GB21904‑2008)的要求。