本发明提供一种中药抑菌组合物，按重量份计，包括0.1～2份抑菌原料、7～50份中草药原料和0.02～0.2份表面活性剂。本发明所述中药抑菌组合物制备而成的抑菌剂，经使用测试可知，口感微甜、无苦味或微有苦味，且无不良反应，不会造成牙齿发黄，使用后异味完全消除、且一周内不再复发；对口腔致病菌变异链球菌、金黄色葡萄球菌、白色念球菌、大肠杆菌表现出良好的抑菌率，且不会破坏口腔内微生态平衡。此外，本发明所述中药抑菌组合物制备而成的抑菌剂，性平质润，还能够清热燥湿、泻火解毒，同时还能缓解牙龈肿痛、保护口腔黏膜，促进牙釉质的形成，建立动态平衡的口腔微生态环境。