本发明涉及一种多房棘球蚴亚单位疫苗LTB‑Emy162的设计、制备方法和应用，多房棘球蚴亚单位疫苗LTB‑Emy162的活性成分是一条多肽，主要由多房棘球蚴抗原蛋白Emy162氨基酸序列以及黏膜免疫佐剂大肠杆菌不耐热毒素B亚基(LTB)氨基酸序列构成。本发明主要通过基因合成技术合成多房棘球蚴亚单位疫苗LTB‑Emy162基因序列，通过双酶切连接至表达载体中，然后将表达载体转化进Arctic Express进行融合蛋白的表达。蛋白纯化后，获得多房棘球蚴亚单位疫苗LTB‑Emy162。该多房棘球蚴亚单位疫苗能够诱发机体产生针对多房棘球蚴T细胞及B细胞免疫应答和高滴度特异性抗体体液免疫应答，可用于预防和治疗多房棘球蚴感染相关性疾病。