本发明涉及一种过量表达ATP酶的基因工程醋酸菌的构建方法，包括如下步骤：a.将乙醛脱氢酶启动子、ATP酶基因以及可在醋酸菌中稳定复制的质粒依次连接，得到重组质粒；b.将经过a步骤得到的重组质粒转入醋酸菌中，即得。本发明还提供该构建方法得到的过量表达ATP酶的基因工程醋酸菌及其应用。本发明的过量表达ATP酶的基因工程醋酸菌，能够增加醋酸菌中ATP酶的表达量，在醋酸发酵中能够提高发酵效率，降低生产成本。