一种人体微生态系统芯片，属于医药研究及人体相关监控应用领域，使用“PDMS A板‑多孔膜‑PDMS B板”的三明治结构实现下层PDMS A板构建肠‑肝‑心脏/脑‑女性生殖道系统集成“器官芯片”模拟真实人体血液循环；上层PDMS B板中培养人体微生物；多孔膜从含人体微生物的培养基中过滤出人体微生物代谢物，由PDMS B板进入PDMS A板中。在PDMS A板中各细胞培养腔室之间的微流设有微阀，通过控制微阀调节培养基流动。本发明可用于精准、精简、高效研究、评测与管控人体微生物代谢物和该个体多“器官”之间的相互作用；通过在培养腔内培养对应人体细胞及控制培养基的流动，实现对真实人体存在的脑脊液循环及直接神经连接的仿生，为医药研究及人体相关监控应用奠定研究基础。