本发明公开了一种多功能核酸基杂化纳米凝胶及其制备方法，步骤为：(1)含粘性末端的多支状核酸纳米结构的制备；(2)将步骤(1)所得的具有互补序列粘性末端的多支状核酸纳米结构进行等量混合，制备树枝状核酸网络纳米结构；(3)将步骤(2)得到的树枝状核酸网络纳米结构和多酚羟基的小分子或高分子化合物进行混合，制备多功能核酸基杂化纳米凝胶。本发明的核酸基杂化纳米凝胶，制备过程简单，方法绿色环保，通过改变树枝状核酸网络纳米结构和多酚羟基的小分子或高分子化合物的比例可精准调控纳米凝胶尺寸，实现高效的细胞摄取效率。通过充分利用核酸纳米结构的多功能性和可编程性，进行高效的基因/化学联合治疗。