本发明属于医药制造技术领域，尤其涉及一种合成甲硝唑原料药的新型微管反应工艺及其应用。旨在克服现有甲硝唑的产业化生产工艺的缺点，提供新的生产工艺。主要过程包括：在高温条件下配制2‑甲基‑5‑硝基咪唑的高浓度混酸溶液，混酸为甲酸与浓硫酸的混合溶液；将混酸溶液与环氧乙烷分别同时送入微型盘管中反应，微型盘管置于90～95℃液体媒介中；减压蒸馏得到反应浓缩液；将反应浓缩液稀释后，中和至pH 2.0‑2.5，冷却、过滤；将步骤4中的滤液中和至pH 10‑11，冷却、过滤，滤饼水洗至中性，得粗产品；将粗产品重结晶、脱色，得到甲硝唑精制产品。该工艺条件温和，反应时间短，安全性高，适合连续化工业生产。