本发明涉及Metrnl蛋白或基因在调节抗菌肽表达中的应用。本发明采用免疫组化和定量PCR显示了人体和小鼠胃肠道组织中Metrnl高表达，首次建立了Metrnl肠道上皮细胞特异性敲除小鼠模型，基于该模型证实肠道上皮细胞缺乏Metrnl引起肠道抗菌肽表达下调。因此，Metrnl蛋白或基因及其增效剂可用于制备治疗或改善抗菌肽不足或失衡疾病的试剂，制备调节抗菌肽表达的试剂，并用于抗菌肽相关疾病药物的开发。