本发明提供了一种带有柱筛并以生物材料作为相互作用相的毛细管、其制备方法以及通过毛细管电泳方法在研究生物大分子与活性配体或化合物相互作用以及药物筛选中的用途。针对某些生物活性大分子从细胞或离体生物组织中分离纯化难度大且会引起天然构象的变化，本发明开发了将生物材料(例如生物大分子超表达的细胞、细胞、线粒体、离体组织、肿瘤组织、载带生物靶固体物质等)注入带有柱筛的毛细管中，所述生物材料被拦截于柱筛后端作为相互作用相，建立非固定化生物材料毛细管电泳(Non‑immobilized Biomaterial Capillary Electrophoresis，NIBCE)，在接近生理环境条件下，用于研究生物大分子与活性配体或化合物相互作用以及药物筛选等的毛细管电泳方法。