本发明提供了一种发酵生产辛伐他汀酰化酶的方法，本发明属于发酵工程技术领域，所述方法，包括以下步骤：1)将重组大肠杆菌CH39807种子液接种至发酵培养基中36～38℃进行菌体发酵；2)当发酵液的OD600值为20～35时，开始对发酵液进行降温，降温至25℃，当所述发酵液的温度≤30℃时，加入IPTG诱导表达10～12h后，收集菌体；3)重悬收集到的菌体后，进行均质、絮凝、固液分离，收集上清酶液。所述方法发酵周期短、发酵获得的酶活力单位高、产量稳定、提取简单。