本发明公开了柴辛注射液中柴胡和细辛的质检方法，以正己醛作为柴胡的标记物，以甲基丁香酚作为细辛的标记物，采用气相色谱仪在同一色谱条件下分别对柴胡的标记物和细辛的标记物进行检测；具体包括正己醛的提取、甲基丁香酚的提取和正己醛的检测、甲基丁香酚的检测等步骤。本发明方法中以正己醛作为柴胡的标记成分，以甲基丁香酚作为细辛的标记成分，解决了正己酸响应值低、灵敏度差的问题。同时，本发明解决了甲基丁香酚峰拖尾严重、分离度差等问题。使用本发明的方法对柴辛注射液中柴胡和细辛的含量进行检测，结果准确可靠、操作便捷、且能够同时对这两种主要成分的含量进行检测，提高了检测效率。