本发明首先公开了一种卤醇脱卤酶突变体及其应用。本发明采用数据库挖掘技术，挖掘潜在的卤醇脱卤酶基因，并在工程菌中进行诱导表达，得到一种新的卤醇脱卤酶；对酶进行半理性设计改造，以(R, S)‑PGE为模式底物，获得2个立体选择性提高的突变体，分别是Q159L和N160L，其对映体选择率分别约从9.85提高到21.80和21.10，其中突变体N160L的选择性和原始酶是相反的；两突变体多种底物的选择性均有一定程度的提高，尤其是突变体N160L对底物对甲基苯基缩水甘油醚的E值提高到了25.77，是原始HHDHHis的13.93倍。