本发明涉及一种利用维生素发酵废弃物生产的有机肥及其制备方法，该有机肥是由下述重量配比的原料发酵而成：古龙酸结晶母液3～20%，古龙酸膜浆10～40%，抗生素废水污泥40～80%，粉煤灰3～20%。本发明将古龙酸结晶母液、古龙酸发酵液经过膜浓缩所得的古龙酸膜浆、经水解酸化、厌氧消化和好氧消化处理抗生素废水后产生的抗生素废水污泥同粉煤灰混合发酵制备有机肥，既可以实现废物资源的再利用，增加企业经济效益，同时又可解决发酵企业带来的工业污染问题。