本发明涉及中药现代化研究领域，是一种使用分子克隆及基因测序技术制备川贝母对照药材DNA克隆液的方法。该方法包括：川贝母对照药材基因组DNA的提取，目的基因PCR扩增和回收；目的基因与PGM‑T载体连接组成重组DNA分子；重组DNA分子转化到DH5α感受态细胞中；“蓝‑白斑”筛选出阳性菌落；提取重组质粒DNA，PCR扩增验证目的基因的正确性；目的基因序列测定与川贝母靶基因进行比对等步骤。本发明能够准确无误的制备出川贝母对照药材DNA克隆液。直接反映贝母独一无二的DNA序列，检测结果具有高度的稳定性、可靠性。并且使得川贝母对照品取之不尽用之不竭，节约更多的正品川贝母用于临床治病救人。