本发明公开了一种褐藻胶裂解酶Algb的基因序列及其制备方法与应用。本发明所涉及到的褐藻胶裂解酶Algb来源于来源于Vibrio alginolyticus40B。本发明提供了制备该新型褐藻胶裂解酶的方法，即使用基因工程的方法，将该褐藻胶裂解酶的编码基因克隆到大肠杆菌表达载体上，从而获得可以异源表达该酶的大肠杆菌重组菌株，用该菌株异源表达制备的褐藻胶裂解酶Algb，具有降解褐藻酸钠制备褐藻酸钠寡糖的功能。本发明提供的褐藻胶裂解酶Algb可广泛应用于化工、农业、食品、饲料添加、医药及海藻遗传工程等领域。