本发明公开了一种益生菌组合物及其制剂与应用，包括VSL#3、鼠李糖杆菌(Lactobacillus rhamnosus)M9以及植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)P‑8；所述VSL#3、鼠李糖杆菌M9和植物乳杆菌P‑8按照含菌量1：1：1等比混合。该益生菌组合物在制备治疗或预防肺炎药物中的应用，尤其是由呼吸道合胞病毒感染导致的肺炎，特别是由呼吸道合胞病毒感染导致的婴幼儿支气管肺炎。本发明益生菌组合物可缓解RSV感染导致的肺组织炎性病理结构的改变，同时可抑制RSV感染的病毒感染进程；能够激活肺泡巨噬细胞中的TLR3和RIG‑1信号通路以促进IFN‑β的产生以抑制肺部炎症因子的表达；能够调节肺部菌群以及与肠道菌群，来缓解RSV病毒感染。