本发明公开了一种含百里香酚与粪肠球菌活菌的发酵物及其制备方法与应用；所述含百里香酚与粪肠球菌活菌的发酵物由发酵混合物和百里香酚混合而成；所述发酵混合物通过发酵用量的驯化粪肠球菌对由炒麦芽和炒焦大豆组成的营养混合物进行发酵得到；所述驯化粪肠球菌由含有微量百里香酚的粪肠球菌培养基传代培养得到。使用所述制备方法得到的含百里香酚与粪肠球菌活菌的发酵物作为饲料添加剂的应用。本发明使粪肠球菌的保存期大大延长，作为饲料添加剂用于促进动物生长和生产其性能远远高于单独使用百里香酚或粪肠球菌。