本发明公开了肺炎衣原体抗原短肽及其应用。所述肺炎衣原体抗原短肽序列如SEQ ID NO : 1‑16任一所示。该短肽具有与DC细胞上MHC I类和MHC II分子高度的亲和力，并能有效地使其起到抗原提呈作用，具备良好的多肽疫苗及DC疫苗的潜力。将该短肽中的至少一条体外致敏树突状细胞，制备的DC疫苗能够预防肺炎衣原体相关疾病，尤其是相关慢性疾病，具有良好的临床转化前景。而且，本发明的抗原短肽长度较短，化学合成难度小，可以直接合成得到高纯的产物，应用成本大大降低，同时效果明确，具有很好的应用前景。