本发明公开了二聚四氢Xanthone类化合物及其制备方法和应用。二聚四氢Xanthone类化合物，结构如式(I)表示。本发明从产紫青霉(Penicillium purpurogenum)SC0070发酵产物中分离得到四个新的二聚四氢Xanthone类化合物，抑菌试验表明这些化合物对金黄色葡萄球菌(MSSA)、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)和痢疾志贺菌(Shigella dysenteria)有显著的抑制作用，体外抗肿瘤试验表明这些化合物对肿瘤细胞株人肺癌细胞A549、人宫颈癌细胞Hela、人肝癌细胞HepG具有显著的细胞毒活性，同时对正常细胞非洲绿猴肾细胞Vero具有选择性，该类化合物可以用于医药中作为抗菌剂、细胞增殖抑制剂或抗肿瘤药物。