本发明公开了一种咖啡豆的处理方法及其提取物提纯方法，涉及化合物提取纯化领域。本发明包括一种咖啡豆的处理方法，依次包括以下步骤：S1：利用混合溶剂初步提取；S2：分步萃取，依次在碱性环境和酸性环境进行萃取；S3：柱层析；以达到操作简便、易于产业化的目的。本发明还包括一种咖啡豆提取绿原酸的提纯方法，包括前述的一种咖啡豆的处理方法，将处理咖啡豆得到的绿原酸通过醇类溶剂进行重结晶，并加入活性炭进行脱色；以实现对从咖啡豆中提出的绿原酸进行简便。易于产业化的提纯。