本发明公开了一种生物药品运输系统，属于生物药品技术领域，包括运输载体检测模块、运输过程的运输环境的监控模块、运输过程的外部因素监控模块、运输完成药物检测模块、药物卸载模块，所述药物卸载模块在所述运输完成药物检测模块监控完成后进行药物卸载；采用本发明的生物药品运输系统，包括对运输载体的表面消毒标准进行再次测试，以及运输载体的泄露性检测，确保药物运输的运输环境良好，通过运输完成药物检测模块包括在药物运输完成后对药物进行抽样检查，确保药物的无损性。