本发明涉及治疗黄褐斑的相关领域，更具体地，本发明提供一种治疗黄褐斑的含重组水蛭素的中药外用组合物及其制备方法。本发明的第一方面提供一种治疗黄褐斑的含重组水蛭素的中药外用组合物，按重量百分比计，制备原料包括3～15％的水相组分、0.5～3％的油相组分、3～12％重组水蛭素发酵液、0.5～2％中药组分、0.1～1％的助剂以及余量水；其中，水相组分包括精氨酸。与现有技术相比，本发明提供的治疗黄褐斑的外用组合物通过重组水蛭素发酵液与中药组分相结合的方法，对于不同年龄段的均具有较好的治疗效果，且本发明提供的组合物具有稳定的理化性能，储存稳定性较好，可以较好的延长相关产品的保存时间。