本实用新型公开了一种用于手性化合物两相酶催化耦合萃取装置，包括底物料筒、料液出口和有机溶剂出口，所述底物料筒的一端表面连接有泵体，且泵体的一端连接有壳程，所述壳程的一端连接酶膜反应器，且酶膜反应器的底端左侧设置有料液进口，所述料液出口设置于酶膜反应器的顶端右侧，且酶膜反应器的右端连接有有机溶剂进口，所述有机溶剂进口的右侧设置有有机溶剂料筒，所述有机溶剂出口设置于酶膜反应器的左端一侧，且有机溶剂出口与有机溶剂料筒之间设置有管程，所述酶膜反应器的内部设置有膜。本实用新型的公开的用于手性化合物两相酶催化耦合萃取装置设计简单，廉价，且利于酶催化效率的提高以及放置萃取乳化现象的产生。