本发明公开了一种口服式动物双歧杆菌微胶囊的制备方法，经过动物双歧杆菌菌悬液的制备、水相的配制、油相的配制、油包水型乳液的制备、固化、离心洗涤和冷冻干燥步骤，完成口服式动物双歧杆菌微胶囊的制备方法；本发明制备工艺简单、高效，制备出的动物双歧杆菌微胶囊，能很好的耐受胃酸及胆盐，且肠溶性好，能在肠道中迅速繁殖。该微胶囊动物双歧杆菌口服后在胃部不解囊，最终顺利到达小肠，通过竞争性拮抗作用紧密结合肠粘膜上皮细胞，在肠道中生长、繁殖，直接补充正常生理细菌，抑制肠道中潜在危害致病菌，调整肠道的菌群平衡，提高机体免疫力。