本发明提出了一种基于霍夫圆变换的网格菌落图像分割方法，用于解决现有技术中存在的不能实现对网格菌落图像进行分割的技术问题，实现步骤为：对网格菌落图像进行预处理；获取去噪后的网格菌落灰度图像中菌落目标的二值化边界图像；采用霍夫圆变换获取去噪后的网格菌落灰度图像中菌落目标的平均半径r和平均灰度值g；采用霍夫圆变换获取去噪后的网格菌落灰度图像中的候选菌落目标标记图像；获取输入网格菌落图像的分割结果。本发明能准确地分割网格菌落图像，可用于对网格菌落图像中菌落目标的检测、计数与分类。