本实用新型属于微生物发酵技术领域，具体涉及一种微生物发酵装置；其结构包括发酵本体、电机和搅拌机构；发酵本体上方设置有电机；电机与搅拌机构连接；搅拌机构包括搅拌轴和搅拌叶；搅拌轴下端与连接座连接；搅拌轴上方为实心轴，下方为空心轴；空心轴上开设有开口；空心轴通过连接套管与进水管连通设置；开口位于连接套管内；连接套管侧面与进水管可拆卸式连接；连接套管套接在空心轴上，并与空心轴相对旋转式连接，连接套管两端与空心轴密封设置；搅拌轴上设置有搅拌叶；搅拌叶内部为中空结构，搅拌叶和空心轴连通设置；储水池底端通过连接管道与进水管连接；本装置实现了发酵本体内的快速降温，易于实现。