本发明公开了一种医药中间体4‑氯吡咯并嘧啶的生产系统，用以由4‑羟基吡咯并[2, 3‑d]嘧啶为反应底物生成4‑氯吡咯并嘧啶的新生产过程，包括用于以4‑羟基吡咯并[2, 3‑d]嘧啶为底物制备4‑氯吡咯并嘧啶的高温高压搅拌反应釜，所述高温高压搅拌反应釜的顶部经带阀门的管道连有用于尾气吸收的碱液池，高温高压搅拌反应釜的底部经管道连有用于将溶剂蒸出的蒸馏塔，所述蒸馏塔连有冷凝溶剂蒸汽的冷凝器和洗涤产品的洗涤釜，所述冷凝器连有回收溶剂的溶剂回收罐，所述洗涤釜连有将固体状产品分离出来的抽滤桶。由于新生产方法无需使用大量POCl3，淬灭过程安全，从而使得整套装置为封闭式，排放的有毒气体少，能实现绿色生产的目的。