本发明的目的在于提供一种简单适合大规模生产的吡咯喹啉醌二钠盐晶体及其制备方法，所述吡咯喹啉醌二钠盐晶体的制备方法包括将含有吡咯喹啉醌游离态或其碱金属盐的水溶液的pH调节至7.5‑8.5，然后加入酸调节pH至3.0‑4.0，通过脱盐、结晶、干燥得到吡咯喹啉醌二钠盐晶体。本发明提供的制备方法简单，容易控制，得到的吡咯喹啉醌二钠盐晶体几乎无引湿性。