本发明公开了一种结晶海藻糖母液循环利用方法，属于食品技术领域。本发明的利用酶制剂对色谱分离后的母液中三糖及三糖以上的寡糖糖化成葡萄糖，利用蛋白酶对可溶性蛋白水解，通过脱色与离子交换去除杂质，结晶后海藻糖成品达到国标要求，纯度最高可达99.5％。实现了海藻糖生产过程中结晶母液的高效、高附加值的利用。