本发明公开了一种含氟聚己内酯膜及其制备方法：将聚已内酯与氨基醇化合物反应，制备端羟基聚己内酯；将端羟基聚已内酯与酸酐反应，制备端羧基聚己内酯；将溴代异丁酸乙二醇酯与含氟烷基丙烯酸酯反应，制备端羟基含氟聚丙烯酸酯；将端羧基聚己内酯与端羟基含氟聚丙烯酸酯反应，制备含氟聚己内酯；室温下，将含氟聚己内酯溶解于有机溶剂中，配制成溶液；然后将溶液室温下自然干燥成膜，制备含氟聚己内酯膜。本发明含氟聚己内酯膜制备时，通过预先制备端基活化含氟聚合物，在均相体系中得到含氟聚合产物，易于控制聚合度。解决了由于溶解性发生转变、难以直接在PCL链端原位生成含氟聚合物链的难题，避免了PCL降解。