本发明公开了一种小金丸指纹图谱的检测方法。本发明首次将小金丸的脂溶性与水溶性成分拆分开，分别优化建立两个部位的指纹图谱，通过双部位双波长的质量控制思路，实现小金丸质量的整体控制，促进小金丸质量标准体系的提高，保障临床疗效。