一种小分子透过分离用多孔膜、其制备方法及应用。本发明涉及一种对小分子化合物高选择性透过率、抗污染的高分子膜及其制备和应用，该高分子膜由含有电中性亲水官能团的、有较高强度的高分子构成。其制备方法为：将特定的高分子溶解后，在溶液中添加小分子添加剂，形成均相溶液，将其浸没在凝固浴中湿法相转化成膜，通过进一步修饰构建具有电中性超亲水分离膜。本发明的高分子分离膜为具有纳米级至亚纳米级的孔道的电中性的超亲水分离膜材料，能使得各种荷电性小分子化合物快速透过分离膜，而大分子化合物被截留，并且在分离过程中能大大降低甚至去除在分子分离过程中分离物对膜的粘附和污染。本发明所涉及的高分子膜材料在染料分离，药物中间体分离，中药有效成分分离浓缩等领域的应用。