本发明公开了一种水性复合佐剂、其应用及猫用疫苗，属于生物医药技术领域。其中，每毫升该水性复合佐剂包括以下组分：注射用母牛分支杆菌肽0.5~3mg、黄芪多糖1~5mg、白介素‑7 10~100μg、氢氧化铝胶0.1~0.2mL、稳定剂100~300mg。本发明实施例提供的一种水性复合佐剂，以水作为溶剂，其对注射部位刺激性较小、不易发生过敏，将该水性复合佐剂与抗原混合制成的猫用疫苗既安全又高效。