本发明属于植物活性成分提取技术领域，尤其是一种生姜复合提取物的制备方法及其应用。所述生姜复合提取物的制备方法，是将粉碎的鲜姜添加到糖混合溶液中经复合菌剂处理后提取制成。所述混合糖溶液中含有10‑15w％生蜂糖、6‑8wt％大蒜汁液、0.05‑0.1wt％食品级氯化钙；所述复合菌剂为液体菌剂，其中含有荧光假单胞菌、枯草芽孢杆菌、青霉菌。本发明采用混合糖溶液、复合菌剂对生姜处理后再进行提取，能增加生姜中的活性成分，促进生姜活性组分的吸收。本发明所制备的生姜复合提取物可制成降血脂药物，患者吸收好、疗效快。