本发明公开了一种属于精细化工催化合成技术领域，更具体地，涉及一种过氧取代的吡咯/呋喃并吲哚啉的制备方法。其通过“一锅两步法”，以色胺衍生物、色氨酸甲酯衍生物或色醇为底物，以有机碘盐为催化剂，在氧化剂存在条件下，所述催化剂与所述氧化剂作用生成高价碘物种；所述高价碘物种活化所述底物，构建含有过氧键和双键的中间产物，然后在还原剂的作用下，将所述中间产物的双键还原，得到过氧取代的吡咯/呋喃并吲哚啉。该方法具有绿色环保、收率高、条件温和、操作简便等特点。