本实用新型涉及农业领域技术领域，且公开了一种瓜蒌籽清洗装置，包括箱体，所述箱体的上下两端分别固定连通有进料口和出料口，所述进料口和出料口的相向端通过密封轴承共同转动连接有内筒，所述箱体外安装有驱动机构，所述驱动机构的输出端固定连接有主动齿轮，所述内筒外靠近上端的侧壁上固定套接有从动齿轮，所述主动齿轮与从动齿轮相啮合，所述内筒的筒壁上开设有若干个细孔，所述进料口和出料口通过连接杆共同固定连接有固定杆，所述固定杆的杆壁上均匀地固定连接有若干个搅拌杆，所述内筒内固定连接有若干个漏斗形的挡板。本实用新型使得能够连续不断地对瓜蒌籽与瓜瓤进行分离清洗，提升了加工效率，且稳定可靠。