本发明公开了一种纳米羟基磷灰石包覆的中空聚合物微球及其制备方法和应用。该方法包括如下步骤：(1)将纳米羟基磷灰石分散到水，得到纳米羟基磷灰石分散液；(2)将羟丙基纤维素接枝己内酯共聚物溶于有机溶剂中，得到羟丙基纤维素接枝己内酯共聚物溶液；(3)将纳米羟基磷灰石分散液加入到羟丙基纤维素接枝己内酯共聚物溶液中，震荡混合均匀，然后在常温下静置挥发，干燥，得到纳米羟基磷灰石包覆的中空聚合物微球。本发明制备的纳米羟基磷灰石包覆的中空聚合物微球不仅其本身具有良好的生物相容性和生物活性，而且其具有较大的空腔，可以对油溶性药物等实现包覆并达到缓释效果，其在生物医药领域具有潜在应用价值。