本发明提供了一种新的海藻抗炎提取物的制备方法，提高小分子海带提取物中岩藻聚糖硫酸酯的透皮效果，从而有助于其在抗炎类化妆品中的应用。发明包括如下步骤：(1)水提法提取海带粗多糖；(2)高压脉冲电场处理步骤(1)获得的海带粗多糖溶液；(3)步骤(2)获得的粗多糖用过氧化氢法裂解；(4)通过滤膜处理，脱除杂质并保留所需的分子量范围。本发明通过对富含岩藻聚糖硫酸酯的海带水提取物进行特定的高压脉冲电场处理，有效提高了其裂解产物中岩藻聚糖硫酸酯的透皮效果，解决了传统小分子海带提取物透皮效果不理想的问题。本发明不使用促炎、对皮肤有不良影响的透皮促进剂，使化妆品成分更加安全。