本实用新型公开一种带隔离器的原料药自动出料装置，包括出料单元和环境隔离单元，出料单元包括框架本体和吸料枪；环境隔离单元包括隔离罩、灭菌气体发生装置和空气流动系统，隔离罩罩设于所述框架本体上面，所述吸料枪容置于所述隔离罩内，隔离罩上设有料枪进出口、进风口和出风口，所述料枪进出口处设有密封板；灭菌气体发生装置用于产生灭菌气体送入所述隔离罩内；空气流动系统用于在隔离罩内形成从所述进风口流向所述出风口的气流。本实用新型通过隔离罩将吸料枪进行隔离，再通过灭菌气体发生装置产生灭菌气体充入隔离罩内，不仅对隔离罩内的吸料枪起到杀灭细菌作用，也对隔离罩内环境进行灭菌，为药块的吸取提供了安全可靠的无菌环境。