本发明提供了一种耐铜锌的盐酸土霉素降解菌及其发酵液和应用，所述耐铜锌的盐酸土霉素降解菌于2019年11月4号，保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中心，保藏号CGMCC N0.18794。本发明的耐铜锌的盐酸土霉素降解菌具有很好的耐四环素类抗生素、氯霉素和铜锌离子的能力，能在抗生素与铜或锌离子交叉的平板上生长，扩大了本发明降解菌的使用空间。而且，铜离子的存在还提高了对盐酸土霉素降解率。另外，本发明耐铜锌的盐酸土霉素降解菌与萝卜具有亲和性，可促进萝卜种子生长，提高产量，可作为生物肥料。