本发明涉及壳聚糖衍生物的制备领域，针对现有羧甲基壳聚糖制备步骤多、试剂危险的问题，提供一种利用南极磷虾壳制备羧甲基壳聚糖的方法，包括以下步骤：1)预处理：将南极磷虾壳洗净、烘干、粉碎过筛，依次脱钙、脱蛋白、脱色；2)将步骤1)的产物加入氢氧化钠溶液中120‑140℃反应4‑7h，反应结束后调至中性、过滤、干燥得到壳聚糖；3)将壳聚糖溶于醋酸溶液中，加入甲醇稀释并搅拌得到壳聚糖溶液，将琥珀酸酐溶于丙酮中，加入所述壳聚糖溶液中，反应得到黏性溶液，调pH为9‑11，用丙酮溶液洗，冷冻干燥得到羧甲基壳聚糖。本发明在省去碱化处理、避免使用异丙醇和氯乙酸的情况下，仍有较高的取代度，改善操作环境、简化流程。