本发明涉及一种用于治疗脑缺血的药物组合物及其制备方法，所述药物组合物包括如下重量份配比的原料组成：丹参、红花提取物磷脂复合物30～50份、大豆油70～90份、中链甘油三酯160～180份、乳化磷脂10～20份、泊洛沙姆‑188，7～13份、甘油7～13份、油酸0.5～2份、VE 0.5～2份、EDTA‑Na20.03～0.1份、余量为注射用水；该药物组合物可以制成鼻腔亚微乳制剂，具有脑靶向作用强、生物利用度高、副作用小的优势。该制备方法科学合理、适合工艺化大生产，应用前景广阔。