本发明公开一种白芨葡甘聚糖酯的制备方法，本发明包括以下步骤：(1)将白芨葡甘聚糖分散于蒸馏水中，用磷酸缓冲液调节pH至6.0，加入β‑甘露聚糖酶，于50‑60℃保温振荡后，煮沸灭酶；(2)白芨葡甘聚糖的酯化：将步骤(1)中的产物溶于有机溶剂或有机溶剂与水的混合物中，然后加入C6～C20饱和脂肪酸、脂肪酶搅拌反应，将获得的反应液进行纯化，制得白芨葡甘聚糖酯。本发明还提供上述制备方法制得的白芨葡甘聚糖酯在制备乳化剂和微囊粉中的应用，本发明的有益效果在于：本发明制备的疏水性白芨葡甘聚糖通过自组装成纳米胶团，增强包裹物在水溶液中的分散性，延长释放时间，且制备方法简单。