本发明公开了一种促进TFEB核转位的短肽及基于其的线性短肽和其减轻脑缺血损伤的应用，属于生物医药技术领域。本发明公开的短肽是一种由TFEB蛋白与14‑3‑3蛋白结合的功能区域融合而成的短肽，其核苷酸序列如SEQ.ID.NO.1所示。本发明还公开了保护上述短肽的线性短肽，由穿膜肽与上述短肽融合而成。本发明通过实验验证了合成的融合肽能够调控TFEB核转位，促进CMA减轻细胞损伤。因此，公开了其减轻神经元死亡以及改善脑缺血损伤的治疗新靶点的应用。