本发明提供了一种多通道独立抽液独立操作的合成仪，包括相互连接的气路液路系统、废液真空系统以及机械运动系统。根据本发明的实施方式，气路液路系统通过控制气体例如氩气、氮气的进出，来实现试剂的注射，同时气体还可以保护试剂不受污染；废液真空系统可对合成仪在操作过程中产生的废液进行回收和排除；机械运动系统可控制试剂加入到合成柱内。实现了在对DNA、RNA、LNA、UNA、硫代和修饰等的合成过程中独立抽液、独立操作和独立控制的效果，达到了独立合成的目的。