本发明公开了一种医药中间体4‑氯吡咯并嘧啶的合成方法，以4‑羟基吡咯并[2, 3‑d]嘧啶为反应底物，以NMP/甲苯的混合溶液为溶剂，加入2.0～4.0当量的1, 2, 3‑三氯丙烷，于100～120℃、氯气环境下回流、搅拌反应4～5小时，160～180℃条件下，抽负压蒸去多余溶剂得到油状物，开启搅拌并向油状物中加入0.5～1mol/L的氢氧化钠溶液，过滤干燥后即得4‑氯吡咯并嘧啶产品。通过新方法替代POCl3的使用，以解决现有合成方法存在淬灭危险、工作效率低下的问题。