本发明涉及含有有效成分为菊花提取物及3，5‑二咖啡酰奎宁酸的用于预防或治疗肌肉疾病的组合物，具体是在肌细胞中减少作为参与肌蛋白分解的主要生物指标的atrogin‑1和肌环指蛋白‑1(MuRF‑1)的信使核糖核酸(mRNA)表达，增加作为参与肌蛋白形成的主要生物指标的哺乳动物雷帕霉素靶(mTOR)蛋白和与肌肉分化相关的作为生物指标的肌细胞生成素(myogenin)和生肌决定因子(MyoD)的信使核糖核酸表达，从而可减少肌肉损失，可利用于肌肉疾病的预防、治疗或肌功能的改善。并且，上述菊花提取物或3，5‑二咖啡酰奎宁酸使作为参与运动执行能力的主要生物指标的沉默调节蛋白1(SIRT1)及P GC‑1α的活性增加，从而具有显著提高运动执行能力的效果。并且，由于本发明为天然物质，可以安全地使用而没有副作用，并且可用作医药品、食品或化妆料。