本发明属于发酵技术领域，具体涉及一种连续原位分离装置，包括壳体及壳体内腔，壳体内腔的下部设置隔板，隔板将壳体内腔分割成上部的分液仓和下部的静置仓；分液仓对应位置的壳体上设置有出口管和进口管，出口管位于进口管的上部，出口管与进口管间的分液仓内设置至少一层分液挡板，每层分液挡板相对水平面呈30‑60度角度倾斜，每层分液挡板上设置有溢流口和回流口，从上至下位于最底层的分液挡板的回流口通过回流导管连通静置仓；隔板上设置的导流通道连通最底层的分液挡板与隔板间的分液仓；壳体的底部设置有底阀，底阀连通静置仓。本发明装置使发酵液始终处于循环状态，减少菌体损失，降低染菌风险，易于工业化生产。