本发明涉及一种小檗碱的提取方法，属于药用植物有效成分提取技术领域。本发明的小檗碱的提取方法，包括以下步骤：将中药粉体和提取溶剂置于提取容器中，密闭提取容器后在100～140℃进行提取，提取结束后固液分离，得到小檗碱提取液；所述提取溶剂为乙醇和水的混合液，提取溶剂中的乙醇的体积浓度为30～70％；中药粉体选自黄连粉体、黄柏粉体中的一种或两种。本发明的小檗碱的提取方法，操作简便，无提取溶剂挥发，安全无毒，所需设备廉价易得，提取成本低；并且在较高温度和自生压力的协同作用下，促使了植物细胞壁的裂解或水解，使细胞内的活性组分能够高效、快速的溶出，有效的提高了小檗碱的提取率和提取效率。